Người ta đã chú ý nhiều đến điều bí ẩn mà nhan đề cuốn sách đề cập đến. Trên thực tế, Eco đã tuyên bố rằng ý định của anh ấy là tìm một "danh hiệu hoàn toàn trung lập". Trong một phiên bản của câu chuyện, khi viết xong cuốn tiểu thuyết, Eco vội vàng gợi ý mười cái tên cho nó và yêu cầu một vài người bạn của mình chọn một cái. Họ đã chọn Tên của đoá hồng. Trong một phiên bản khác của câu chuyện, Eco đã muốn có tựa đề trung lập là Adso of Melk, nhưng điều đó đã bị nhà xuất bản của anh ấy phủ quyết, và sau đó tựa đề Tên của đoá hồng "gần như tình cờ đến với tôi." Trong phần tái bút cho Tên của bông hồng, Eco tuyên bố đã chọn tiêu đề "bởi vì bông hồng là một nhân vật tượng trưng giàu ý nghĩa đến mức bây giờ nó hầu như không còn ý nghĩa gì".

Dòng cuối cùng của cuốn sách, "Stat rosa pristina nomine, nomina nuda tenemus" được dịch là: "bông hồng của tuổi già chỉ còn lại cái tên của nó; chúng ta sở hữu những cái tên trần trụi." Cảm giác chung, như Eco đã chỉ ra,là vẻ đẹp của quá khứ, giờ đã biến mất, chúng ta chỉ giữ lại cái tên. Trong cuốn tiểu thuyết này, “bông hồng” đã mất có thể được coi là Thi học của Aristotle (nay đã mất vĩnh viễn), thư viện tinh xảo nay đã bị phá hủy, hay cô nông dân xinh đẹp nay đã chết.

Văn bản này cũng đã được dịch là "Bông hồng của ngày hôm qua chỉ có tên, chúng tôi chỉ có tên trống." Dòng này là một câu thơ của nhà sư thế kỷ thứ mười hai Bernard xứ Cluny (còn được gọi là Bernard xứ Morlaix). Các bản thảo thời Trung cổ của dòng này không thống nhất: Eco trích dẫn nguyên văn một biến thể thời Trung cổ, nhưng Eco không biết vào thời điểm văn bản được in phổ biến hơn trong các ấn bản hiện đại, trong đó tham chiếu đến Rome (Roma), chứ không phải thành hoa hồng (rose hay rosa). Văn bản thay thế, với ngữ cảnh của nó, chạy: Nunc ubi Regulus aut ubi Romulus aut ubi Remus? / Stat Roma pristina nomine, nomina nuda tenemus. Điều này được dịch là "Bây giờ Regulus, hoặc Romulus, hoặc Remus ở đâu? / Rome nguyên thủy chỉ tồn tại trong cái tên của nó; chúng tôi chỉ giữ những cái tên trần trụi."

Tiêu đề cũng có thể là một sự ám chỉ đến vị trí duy danh trong vấn đề phổ quát, do William xứ Ockham đưa ra. Theo chủ nghĩa duy danh, phổ quát là những cái tên trần trụi: không có bông hồng phổ quát, chỉ có tên gọi.